Il s'agit de la technique de séparation sur la base du rapport charge-taille. les molécules qui se séparent se déplace à vitesse différente basée sur 1) Charge 2) taille 3) la taille des pores du gel. gel d'agarose est couramment utilisé. la visibilité peut être augmentée par addition de colorants fluorescents avec les échantillons. Des études comparatives sont plus possible que les méthodes chromatographiques.
Chromatographie:
elle est basée sur la nature de la phase stationnaire et une phase mobile. en fonction du type de la séparation de la phase stationnaire peut être changée. elle accueille tous les trois formes d'une molécule (eau, liquide, solide). il est très pas cher à mettre en place l'expérience a comparé l'électrophorèse.