Il n'y a pas de différences pour moi, les PGI ( progiciels de gestion intégré) intègrent des progiciels comptable.
Si l'éditeur n'édite qu'une solution comptable, et bien l'avantage d'un PGI / ERP et d'avoir à la fois un module comptable, mais aussi financier, logistique, commercial, relation client (CRM)... bien évidemment les tarifs seront différents, mais tous ces modules seront liés avec un moteur de workflow et de business intelligence.