Chomage payé par la sncf

Bonjour, J'ai effectué un bts en alternance au sein de la sncf, à la fin de mon contrat n'ayant pas retrouvé de travail, j'ai été au chomage. Ce chomage est payé par la SNCF. J'ai quand meme du m'inscrire a l'anpe, ceux ci mon fait un refus de paiement et j'ai ensuite apporté ces papiers a la sncf qui à fait le necessaire pour me payer mon chomage. Aujourd'hui le pole emploi menace de me radier en tant que demandeur d'emploi car je n'ai pas pu participer a une formation apparament devenu obligatoire. J'aimerai savoir si cela aura une conséquence sur l'indemnité de chomage que me verse la SNCF?