Subrogation

Bonjour, Je suis en arrêt de travail depuis 5 mois et jusqu'ici j'étais payée par subrogation.Mon employeur (une petite école associative) m'a expliqué hier qu'il y avait erreur de leur part et que maintenant plus rien ne devait passer par eux : je dois attendre le versement de mes indemnités par la sécu, les transmettre à la caisse de prévoyance qui me versera à son tour un complément de salaire. En bref, le temps que les démarches se fassent je n'aurais pas de salaire avant deux mois puisque je n'ai toujours pas recu les IJ d'août. Ma question : puis-je demander la poursuite de la subrogation à mon employeur ? Je sais d'avance qu'il fera tout pour m'aider, mais qu'il ne connait pas grand chose au code du travail.Merci d'avance