Indemnités pro btp

Bonjour, mon concubin est en accident du travail depuis le 27/11/08 sachant qu'il a eu une coupure de cet arret car pris ses CP du 24/12/08 au 01/01/09,un nuvel arrêt a été effectué le 02/01/09 jusqu'au 01/05, cet arrêt est considéré comme un arrêt intial par la sécu (car coupure de celui-ci par les CP donc pas d'indemnités sur cette période) mais pas la pro btp et du coup celle ci- démarre les 90 jours d'indemnisations du salaire à 100% au27/11/08 au lieu du 02/01/09 ??? merci