En fait, vous n'avez pas un CDI mais un CDD!
Si vous avez signé un CDD, votre patron doit vous payer les heures, même s'il vous a demandé de ne pas les effectuer. A moins que vous n'ayez trouvé un accord, ce qui ne semble pas être le cas.
Cela dit, si vous n'avez même pas été présente depuis la première heure, je ne vois pas pourquoi il vous paierait pour un travail non effectué.