Contrat pro. et frais de transport

Bonjour, Je suis en contrat de professionnalisation en Ile-de-France et j'aimerais savoir si mon employeur est tenu de me rembourser 50% de mes frais de transport domicile/entreprise (et domicile/formation). Mon employeur me soutient que ne rentrant pas dans le calcul des effectifs et, il me semble, en accord avec la convention collective de l'entreprise, il est prémuni de cette obligation (si tant est qu'elle en est une). Merci.