Reprise du travail sur ordre du médecin conseil

Je suis en arrêt depuis 2 ans Le médecin conseil a notifié une reprise au 1er mai 2009, le médecin du travail m'a mis apte. Mon employeur ne veut pas me reprendre car mon responsable est en maladie. Je dois donc prendre mes congés et il souhaiterait que je les prenne tous. Mais s'il m'arrive un problème de santé, la SS ne me paiera pas d'IJ puisqu'il faut absolument que je reprenne à temps plein. Mon employeur dit qu'étante en congé, je peux être mis en maladie. La SS dit le contraire, le médecin conseil dit que je dois reprendre à temps complet. Je ne sais plus quoi faire, car j'ai un souci de santé, en fait je suis malade en congé. Dites moi mes droits SVP ??? Sachant que le médecin conseil de la SS à raison, l'employeur a t'il le droit de ne pas me reprendre pour travailler du fait que mon responsable hiérarchique est malade ????????? MErci